Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms