Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms