Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms