Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpfP62307 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms