Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms