Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2fP61219 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms