Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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