Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms