Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uchl4P58321 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms