Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms