Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PltpP55065 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PltpP55065 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PltpP55065 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PltpP55065 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms