Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms