Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RabggtbP53612 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RabggtbP53612 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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RabggtbP53612 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms