Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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