Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BckdhaP50136 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdhaP50136 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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