Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms