Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms