Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpreP49446 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpreP49446 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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