Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms