Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg3P47867 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms