Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms