Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msh2P43247 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh2P43247 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms