Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3caP42337 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms