Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tac1P41539 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tac1P41539 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tac1P41539 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tac1P41539 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tac1P41539 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms