Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Mmp9P41245 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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