Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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