Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd1P40201 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd1P40201 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms