Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms