Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc5P35689 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms