Protein–RNA interactions for Protein: P31649

Slc6a13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a13P31649 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a13P31649 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms