Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms