Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd28P31041 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms