Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms