Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nckap1P28660 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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