Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax3P24610 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms