Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms