Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PparaP23204 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PparaP23204 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PparaP23204 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PparaP23204 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PparaP23204 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms