Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms