Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms