Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms