Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms