Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms