Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18532 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18532 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18532 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18532 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18532 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18532 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18532 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18532 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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