Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcnaP17918 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms