Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rag1P15919 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms