Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54P14576 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54P14576 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54P14576 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54P14576 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms