Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms