Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms