Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Surf1P09925 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms