Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04214 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04214 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04214 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04214 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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